Christine Dupuy fait de l'écologie marine et en particulier de l'écologie microbienne. Elle étudie la structure et le fonctionnement du réseau trophique microbien en milieu côtier (benthique et pélagique). Professeure à l'université de La Rochelle depuis 2010, elle a publié plus d'une cinquantaine d'articles internationaux, et participe à de nombreux congrès internationaux.

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